Departamento de Informática (UM)

Projeto em Bioinformática

15888 [ME37ME3700007143]

Mestrado em Bioinformática [MBINF]

S2

Miguel Francisco Almeida Pereira Rocha

Objetivos

Os conteúdos programáticos abordam as fases de um projeto de investigação na área da Bioinformática com vista a atingir os objetivos de aprendizagem definidos, pelo que o seu mapeamento é bastante direto.

Programa

- Análise de um problema biológico e do estado da arte ao nível das soluções algorítmicas para a sua resolução.
- Análise de ferramentas computacionais existentes relevantes.
- Estudo dos recursos ao nível de repositórios de software livre.
- Planeamento e desenvolvimento de soluções algorítmicas para o problema em questão.
- Implementação destas soluções usando linguagens de programação.
- Escrita de um relatório e apresentação oral dos resultados.

Bibliografia

A. Hoffman. Scientific Writing and Communication: Papers, Proposals, and Presentations., Nov. 2016, Oxford Univ. Press.
A. Lee. Successful Research Projects: A Guide for Postgraduates. Routledge, 2019.
Adicionalmente, a bibliografia específica vai depender do tema de trabalho do aluno o qual não poderá dispensar revistas científicas da especialidade.

Resultados da aprendizagem

Esta unidade curricular (UC) visa que os alunos desenvolvam projetos práticos na área da Bioinformática que promovam a integração dos conhecimentos adquiridos nas restantes unidades curriculares e a sua consolidação.
Os principais objetivos de aprendizagem são:
- Avaliar criticamente aplicações existentes no campo da Bioinformática;
- Utilizar repositórios existentes de software livre no desenvolvimento de aplicações Bioinformáticas;
- Abordar problemas biológicos usando técnicas computacionais, sabendo identificar e desenvolver os algoritmos mais adequados;
- Implementar aplicações para diversas tarefas em Bioinformática, usando linguagens de programação;
- Escrever um relatório, em forma de artigo, com as principais conclusões de um projeto de investigação e desenvolvimento;
- Apresentar oralmente as principais conclusões de um projeto de investigação e desenvolvimento.

Método de avaliação

Os projetos serão avaliados em 3 vertentes:
- relatório intermédio com estado da arte e análise do problema;
- relatório final em forma de artigo;
- apresentação oral.
O relatório final terá um peso de cerca de 50%, sendo o restante dividido de forma idêntica pelo relatório intermédio e pela apresentação final.

Funcionamento

Turno: PL1; Docente: Emanuel Rodrigues Cunha; Dep.: DEB; Horas: 7.5.
Turno: PL1; Docente: Miguel Francisco Almeida Pereira Rocha; Dep.: DI; Horas: 15.
Turno: PL1; Docente: Óscar Manuel Lima Dias; Dep.: DEB; Horas: 7.5.