Departamento de Informática (UM)

2035

Miguel Francisco Almeida Pereira Rocha

Prof. Associado c/ Agregação

Inteligência Artificial

E-mail
Ext.: +604469

E7-3.14.1

Qualificações: 1995 - Licenciatura em Engenharia de Sistemas e Informática (U. Minho); 1998 - Mestre em Informática (U. Minho); 2004 - Doutor em Informática (U. Minho); 2017 - Agregação em Informática (Univ. Minho)

Página pessoal: http://www.di.uminho.pt/~mpr

Investigação

Centro

CEB

Repositórios

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Publicações selecionadas

• Tânia Barata, Vítor Vieira, Rúben Rodrigues, Ricardo Pires das Neves, Miguel Rocha: 'Reconstruction of tissue-specific genome-scale metabolic models for human cancer stem cells'. Comput. Biol. Medicine 142: 105177 (2022)
• Ana Marta Sequeira, Diana Lousa, Miguel Rocha: 'ProPythia: A Python package for protein classification based on machine and deep learning'. Neurocomputing 484: 172-182 (2022)
• Delora Baptista, Pedro G. Ferreira, Miguel Rocha: 'Deep learning for drug response prediction in cancer'. Briefings Bioinform. 22(1): 360-379 (2021)
• Vitor Pereira, Fernando Cruz, Miguel Rocha: 'MEWpy: a computational strain optimization workbench in Python'. Bioinform. 37(16): 2494-2496 (2021)
• Tiago Sousa, João Correia, Vitor Pereira, Miguel Rocha: 'Generative Deep Learning for Targeted Compound Design'. J. Chem. Inf. Model. 61(11): 5343-5361 (2021)

Projetos

• SHIKIFACTORY100 - Modular cell factories for the production of 100 compounds from the shikimate pathway (2019) ( PI )
• DeepBio – Deep and machine learning for industrial biotechnology (2019)

Docência

Regências:

• Bioinformática (MIEBIOME)
• Bioinformática (MEB)
• Dissertação (MBINF)
• Extração de Conhecimento de Dados Biológicos (MBINF)
• Laboratórios de Bioinformática (MBINF)
• Mineração de Dados (MEINF)
• Métodos de Investigação em Bioinformática (MBINF)
• Projeto em Bioinformática (MBINF)
• Sistemas Inteligentes para a Bioinformática (MBINF)

Aulas:

• Bioinformática [9405N4]: turnos PL 1 e T 1
• Dissertação [ME37ME3700000000]: turno OT 1
• Laboratórios de Bioinformática [ME37ME3700004760]: turno T 1
• Sistemas Inteligentes para a Bioinformática [ME37ME3700004770]: turno T 1
• Métodos de Investigação em Bioinformática [ME37ME3700004772]: turno T 1
• Extração de Conhecimento de Dados Biológicos [ME37ME3700007141]: turnos PL 1 e T 1
• Projeto em Bioinformática [ME37ME3700007143]: turno PL1
• Mineração de Dados [ME78ME7800006084]: turnos PL 1 e T 1
• Aprendizagem Profunda [ME78ME7800006554]: turnos PL 1 e T 1
• Bioinformática [ME79ME7903003064]: turnos PL 1 e T 1

Serviço

• Fundador da spin-off SilicoLife, Lda. (desde 2010)
• É desde 2015 director do Mestrado em Bioinformática da U.Minho
• Professor Auxiliar, U. Minho (2004-2012)
• Assistente, U. Minho, 1998-2004
• Fundador e CTO/CSO da spin-off OmniumAI (em 2021)